Gece Yarısı Bir Çığlık Duydum, gizemli bir sır keşfeden bir genç kızın yaşadıklarını konu ediyor. Katherine 'Kit' Gordy problemli davranışları olan genç bir kızdır. Bu sebeple de özel bir yatılı okul olan Blackwood Okulu'na gönderilir. Bu gizemli okul eksantrik müdüre Madam Duret tarafından yönetilmektedir. Okulun labirent vari koridorlarında yollarını bulmaya çalışan Kit ve sınıf arkadaşları, okulda kaldıkları süre içinde müdürelerinin özel güçlerini ve Blackwood Malikanesi'nin asırlardır doğaüstü bir sırrı sakladığını keşfederler.